Labmedya - Laboratuvar ve Sağlık Gazetesi

Huan Zhang, Yang Guo, Shi Jin, Manman Ma, Lei Cao, Fei Li, Zhaoshan Zhong, Chao Lian, Minxiao Wang, Chaolun Li ve çalışma arkadaşları Pasifik’in farklı bölgelerindeki polimetalik nodüller ile bunlara eşlik eden tortulardan elde edilen 46 metagenomik örneği bir araya getirdi. Veri setinin 22 örneği yeni dizilendi, 24 örneği ise daha önce kamuya açılmış kaynaklardan dahil edildi.

Metagenomik montaj ve gen tahmini sonucunda 147 milyondan fazla protein kodlayan dizi üretildi. Tekrarlanan dizilerin ayıklanmasıyla 65 milyondan fazla temsilci genden oluşan gereksiz tekrar içermeyen bir katalog kuruldu. Genlerin yaklaşık yüzde 62’sine eggNOG, KEGG ve Pfam veri tabanları kullanılarak işlevsel atama yapılabildi.

Genom bölütleme ve yinelenen genomların ayıklanması, 41 farklı bakteri ve arke filumunu kapsayan 617 tür düzeyinde metagenomdan oluşturulmuş genom sağladı. Bu kaynak, nodül yüzeyleri ve çevre tortullarındaki mikroorganizmaların metabolik kapasitesini, biyocoğrafyasını ve ekolojik rollerini karşılaştırmalı olarak incelemeyi mümkün kılıyor. Aynı zamanda derin deniz madenciliğinin olası çevresel etkilerini değerlendirmek için başlangıç düzeyi bir biyolojik referans sunuyor.

Araştırmacılar veri kaynağının gelecekteki çevresel değerlendirmeleri destekleyeceğini vurguluyor; ancak genlerin önemli bir kısmının henüz işlevsel olarak tanımlanamaması, derin deniz mikrobiyolojisindeki bilgi açığını da gösteriyor. Çalışma UN Ocean Decade Digital DEPTH programı, Çin Ulusal Anahtar Ar-Ge Programı, Shandong Deniz Bilim ve Teknoloji Fonu ve Çin Ulusal Doğa Bilimleri Vakfı dahil çeşitli programlarca desteklendi. Makale 24 Ağustos 2026’da yayımlandı.

Kaynak: https://www.nature.com/articles/s41597-026-08067-5