Labmedya - Laboratuvar ve Sağlık Gazetesi

50 yaş altı yetişkinlerde olorektal kanser (CRC) oranları artıyor ve insidans kalıpları küresel bölgelere göre önemli ölçüde değişiyor. Araştırmacılar yaş ve coğrafya ile ilgili değişiklikleri araştırırken, erken başlangıçlı vakaların arkasındaki risk faktörlerine odaklanıyorlar . Çevresel maruziyetler ve belirli yaşam tarzı faktörleri bir kişinin sağlığı üzerinde iz bırakabilir ve genomda mutasyon imzaları olarak bilinen somatik mutasyonların karakteristik kalıplarını oluşturabilir .

Kaliforniya Üniversitesi, San Diego’da kanser genetikçisi olan Ludmil Alexandrov , değişen CRC insidans oranlarından sorumlu olabilecek genetik kalıpları analiz etmek için geleneksel ve mutasyonel epidemiyolojiyi bir araya getiriyor. Alexandrov ve ekibi, yeni bir çalışmada , bağırsakta belirli Escherichia coli suşları tarafından üretilen DNA’ya zarar veren bir toksin olan kolibaktine erken yaşta maruz kalmanın erken başlangıçlı CRC ile güçlü bir şekilde bağlantılı olduğunu buldu.

Ekip, tüm genom dizilimini kullandı ve 11 ülke ve dört kıtada orta ila yüksek CRC insidansına sahip 900’den fazla CRC hastasından mutasyonel desenleri katalogladı. Bunlar arasında, kolibaktin maruziyetiyle bağlantılı mutasyonlar öne çıktı.

İnsanlarda E. coli , sağlıklı bir bağırsak mikrobiyomunun parçasıdır ; ancak, E. coli’nin belirli suşları , çift sarmallı DNA kırıklarına bağlı ve CRC’nin olası bir sürücüsü olan mutajenik bir bileşik olan kolibaktin üretebilir . Bu, iki izlenebilir mutasyon türüne neden olur : tek baz ikameleri (SBS) ve indeller (ID).

Alexandrov’un grubunun da aralarında bulunduğu önceki araştırmalar , tüm CRC vakalarının yüzde 10 ila 15’inde kolibaktinle ilişkili mutasyonlar bulmuştu. Ancak bu çalışmada araştırmacılar, erken başlangıçlı vakalarda daha sık görülen mutasyonlara dikkat çekti : SBS88 ve ID18 mutasyonları, 40 yaşından önce teşhis konulan bireylerde 70 yaş üstündekilere göre 3,3 kat daha yaygındı.

Alexandrov bir basın açıklamasında, « Bu mutasyon kalıpları genomda bir tür tarihsel kayıt niteliğindedir ve erken başlangıçlı hastalıkların arkasındaki itici güç olarak erken yaşta kolibaktine maruz kalmaya işaret etmektedir » dedi .

Önceki çalışmalar bu tür mutasyonların yaşamın ilk on yılında ortaya çıktığını bulduğundan , ekip örneklerinin benzer bir desen sergileyip sergilemediğini görmek istedi. Bu mutasyonların ne zaman meydana geldiğini belirlemek için araştırmacılar tüm tümör hücrelerindeki mutasyonları erken klonal ve yalnızca bazı hücrelerde görülenleri geç klonal olarak sınıflandırdılar. SBS88 ve ID18’in erken klonal mutasyonlarda zenginleştiğini buldular, bu da kolibaktinle ilişkili mutasyonların tümör gelişiminin erken dönemlerinde meydana geldiğini gösteriyor. Ek olarak, araştırmacılar kolibaktinle ilişkili mutasyonların kanser ilerlemesini desteklediği bilinen ek sürücü mutasyonlarıyla bağlantılı olduğunu da buldular.

Alexandrov, « Birisi 10 yaşına geldiğinde bu sürücü mutasyonlarından birini edinirse, » diye açıklıyor, « kolorektal kansere yakalanma olasılığı on yıllar öncesinde olabilir ve 60 yaşında değil 40 yaşında yakalanabilir. »

Alexandrov, « Bu, kanser hakkında düşünme şeklimizi yeniden şekillendiriyor » dedi. « Bu sadece yetişkinlikte olanlarla ilgili değil. Yaşamın ilk on yılında olanlarla ilgili -belki de ilk birkaç yıl. Bu tür araştırmalara sürekli yatırım yapmak, çok geç olmadan kanseri önleme ve tedavi etme yönündeki küresel çabada kritik öneme sahip olacak. »

Yazar: Bassma Bouanani

Kaynakça: https://www.the-scientist.com/childhood-exposure-to-bacterial-toxin-tied-to-early-onset-colorectal-cancer-72952